unix（包含linux）的初學者，常常會很困惑，不明白目錄結構的含義何在。
舉例來說，根目錄下面有一個子目錄/bin，用于存放二進制程式。但是，/usr子目錄下面還有/usr/bin，以及/usr/local/bin，也用于存放二進制程式；某些系統甚至還有/opt/bin。它們有何差別？
當時，他們使用一種叫做rk05的儲存盤，一盤的容量大約是1.5mb。
沒過多久，作業系統（根目錄）變得越來越大，一塊盤已經裝不下了。于是，他們加上了第二盤rk05，并且規定第一塊盤專門放系統程式，第二塊盤專門放使用者自己的程式，是以挂載的目錄點取名為/usr。也就是說，根目錄"/"挂載在第一塊盤，"/usr"目錄挂載在第二塊盤。除此之外，兩塊盤的目錄結構完全相同，第一塊盤的目錄（/bin, /sbin, /lib, /tmp...）都在/usr目錄下重新出現一次。
後來，第二塊盤也滿了，他們隻好又加了第三盤rk05，挂載的目錄點取名為/home，并且規定/usr用于存放使用者的程式，/home用于存放使用者的資料。
從此，這種目錄結構就延續了下來。随着硬碟容量越來越大，各個目錄的含義進一步得到明确。
/：存放系統程式，也就是at&t開發的unix程式。
/usr：存放unix系統商（比如ibm和hp）開發的程式。
/usr/local：存放使用者自己安裝的程式。
/opt：在某些系統，用于存放第三方廠商開發的程式，是以取名為option，意為"選裝"。