第二部開始，劉傑輝老婆女兒被綁架，而幕後BOSS的交換條件就是把李家俊釋放出來。劉傑輝真的會因為家人就放？絕對不可能。幕後BOSS對劉傑輝路線的一系列安排，包括後面港鐵炸彈爆炸就表明了，他們隻是想制造混亂，并且已經不惜代價。這一局，劉傑輝輸了。
局面看起來似乎劉傑輝又轉為被動。李文彬開始通過兒子李家俊第一次接觸幕後BOSS團隊，看到這裡很多人看到李文彬換眼鏡就覺得他叛變警隊了，其實不然。換眼鏡隻是因為眼鏡是他兒子送的，并且希望借這個機會摸清兒子背後的人，并找機會引導兒子脫離幕後BOSS團隊，這一點從李文彬對劉傑輝說，親手送兒子進去隻是想保護他就看得出來。這一切都展現了李文彬對兒子的愛，和第一部親手送兒子李家俊進監獄時的冷面無情遙相呼應，把李文彬人物徹底表明清楚了，立住了，就是李文彬絕對不會因為家人出賣警隊，但同時他對兒子的愛也有自己表現的方法，可能這就是中國父子關系吧，沉默的愛嘛。
立法會第一次詢問的是李文彬，發哥也在這時候出場，并且被幕後BOSS簡單利用，但發哥很快就發現了自己被利用的事實，而李文彬這個時候把劉傑輝押解李家俊在車内的談話和盤托出，應該也是為了迷惑幕後BOSS，看到這裡時我們可以看到，幕後BOSS也一直在盯着李文彬，可以看出來雖然找到了李文彬，并且讓他見到了所有反派，但還是沒有徹底相信他。李文彬在立法會的一番話，應該是打消了幕後BOSS的疑慮，并且有了接下來李文彬的第二次會面。
與此同時，劉傑輝也被立法會找去問詢，而這一次，發哥說了隻是想看一下劉傑輝能看多遠，這就表明了，發哥已經把事情脈絡都掌握了，大家都知道，李家俊是個小頭目，後面還有更大的BOSS，并且這個BOSS有權利，有巨大的能量。發哥開始看好劉傑輝。李文彬第二次同幕後BOSS會面，被發哥侄女跟蹤，并且發哥侄女也被劉傑輝的編外行動隊監聽，由此把所有人串了起來。
李文彬在第二次會面結束，和兒子擁抱時，和兒子的一番悄悄話（讓他找機會逃走），可以說是對兒子撥亂反正最後的一點希望。
這個時候，幕後BOSS因為發哥侄女的跟蹤拍攝，開始逐漸暴露。随後就出現了隧道内槍戰，發哥侄女犧牲，李家俊重傷性命垂危。李文彬找到劉傑輝，兩人爆發口舌，并且李文彬給了劉傑輝一拳。
最後發哥救場，并朝着李文彬說了一句陪他下半輩子的話，這話有兩種效果，第一，表明自己的立場，第二，告訴李文彬自己已經摸清了所有脈絡，要開始反擊了。到這個時候，李文彬因為兒子重傷垂死，最後一絲個人情感被抹殺，我們可以了解為，李文彬沒有什麼顧慮了，要維護警隊并開始刷大了。
李文彬開始和劉傑輝聯手布局，李文彬裝模裝樣答應了回歸警隊，注意啊，這是李文彬的一石二鳥之計，李文彬通過這一舉動不但摸清了在警隊的所有内奸，還成功把焦點從劉傑輝身上轉移到了自己身上，讓劉傑輝有了最大的自由空間去聯絡他的編外行動隊。這時候結局應該是很明晰了，由李文彬打頭陣，摸清包括韓孝忠，莫錦泉在内的所有幕後黑手，叛徒，再由劉傑輝查找證據，并統一時間一緻行動（劉傑輝處長權力交接時），發哥作為輔助，派人協助編外行動隊展開調查。
第二部即将結局時，為了避免這個行動出現纰漏，也就是以劉傑輝最後幾小時做權利交接時，作為行動統一時間，在此之前李文彬和劉傑輝都要在表面上造成一種你死我活的假象。這裡也和劉李兩人職位遙相呼應，作為行動副處長的李文彬負責前線抓捕行動，而此前作為管理副處長的劉傑輝在大學營控制着其他叛徒，可以說到這裡為止，大局已定。
結尾處，已經暴露的所有叛徒都被揪出來，警隊内部恢複正常。這時給了一個李文彬看着重傷的兒子的鏡頭。
那不妨大膽猜測一下第三部的大緻劇情片段，因為第二部所暴露出來的BOSS并沒有完全追捕完，立法會的女的，财神爺，發哥師弟等等，因為第二部沒有證據，是以第三部一定是以李文彬和發哥作為同他們接洽的人，發哥的角色可能會一度黑化，屆時沖突激化，可能會展現出來更高的職位對抗。