假面騎士Build劇場版的故事從戰兔在公路上騎着機車開始的，接到美空和紗羽姐的電話開始。萬丈去參拜香澄（女朋友）的墓，一海去參拜三羽鴉的墓，幻德則睡覺。三都的知事的演說開始了，戰兔将一對姐弟從Smash那解救了出來。因為伊能賢吾的洗腦，群眾們向戰兔襲來。火星滅亡後，為了毀滅地球，Blood族在這10年裡，一直作為影子暗中活動。（注：圖源網絡，若侵權請聯系删除）
一海和幻德被才賀涼香抓住了，這時内海出現了說想要擠壓腰帶就下跪吧。隻有幻德下跪了取回了腰帶。變身解除的戰兔被萬丈奪走了危險扳機，交給了伊能賢吾。與剪刀Smash、斑馬Smash和萬丈三人一樣，伊能賢吾使用【偉大穿越龍】、【眼鏡蛇迷失滿瓶】和【危險扳機】變身成了假面騎士Blood。就在Blood要給肉身的戰兔緻命一擊的時候，Evolto為救戰兔而趕來了。
誰也想不到，戰兔被Evolto所救，在船上醒來。這真是尴尬的一幕，畢竟在主線TV版中，戰兔和Evol可是超級死對頭，兩個人怎麼會出現這一幕呢？在和Blood的戰鬥中，本該被洗腦的美空流下了眼淚，手腕上的手镯掉下來了。戰兔把金色的兔子滿瓶設定進滿滿大炮裡，從Blood那将萬丈分離了出來。萬丈也解開了洗腦，就在那時，斑馬Smash和剪刀Smash襲來，不過一海和幻德趕來幫忙了。
在戰兔和萬丈的面前，解除洗腦的紗羽姐和變成貝魯娜姬的美空現身。因為貝魯娜姬的力量，天才滿瓶與金色的兔子滿瓶和銀色的龍滿瓶融合，【Cross-z Build罐滿瓶】誕生了！戰兔用新的滿瓶變身，龍我正準備離開，結果被卷進了半導體的架構内，與戰兔合體變身成了假面騎士build Cross-z build形态。
在與Blood激戰的最後，金色的兔子出現，build飛跳起來，用銀色的龍的力量，一踢決勝負，滅了Blood。解除變身後，【Cross-z Build罐滿瓶】又變回了天才滿瓶、金兔滿瓶、銀龍滿瓶。最後的戲裡，戰兔在電影最初解救的姐弟前來感謝。算起來就算完結了，隻不過，在結尾的時候，ZIO出現了。
時間魔神出現之後，假面騎士zio從裡面跳了出來。然後zio使用build騎士手表，對戰兔說：“這是你的力量哦！”更新成了假面騎士zio build裝甲形态，算起來故事就算接起來了，後面在9月份即将上映假面騎士ZIO，總之很值得期待！
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