伊森自從遇見了美麗的未婚妻茱莉亞之後，他決定退隐并和未婚妻組建幸福的家庭，不在插手一線的事情，隻是負責訓練IMF機構安全部門新特工。但當兩人還在沉浸幸福的生活中時，伊森徒弟中的最受其器重的女特工琳德賽被歐文·戴維恩抓捕。戴維恩即冷血也無情，他也是國際上最大的軍火販子和情報商人。
為了救出女徒弟，伊森暫時回到組織工作，他再次組織起特工小組，問救援女徒弟，也為粉碎敵人陰謀。一番激烈的戰鬥之後，女徒弟就出來了，但她腦袋裡有一個微型炸彈，伊森差一點點就可以幫她排除炸彈了，但不幸的是，琳德賽死在了伊森的懷裡。
與此同時，戴維恩綁架了伊森的妻子朱莉亞，伊森再次進行救援。隻是這一次伊森不慎被抓，腦袋中也被植入微型炸彈，最後和朱莉亞聯手，殺死戴維恩，伊森也用上次沒來得及對女徒弟使用的救援方法，使自己腦袋中的炸彈失效。
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