他是中國聯賽中任職時間最長的南韓教練，曾執教過前衛的燕島（重慶龍鑫、重慶力帆）、青島煙中（青島貝萊特）、北京國安、廣州恒大、成都天成、長春亞泰;
1998年，當李開複決定接前衛的濤隊教練時，他的南韓朋友勸他要謹慎，因為執教中國職業隊不僅壓力大，而且随時都面臨"下班"的風險。但李章軒卻不為所動，決心拿起前衛的雁島隊教鞭。
執教前衛的魯道（重慶龍鑫、重慶力帆）四個賽季，1999賽季和2000賽季兩次帶領球隊奪得聯賽第四名，2000賽季是在足總杯決賽中以總比分4-2戰勝北京國安隊，當年奪得足總杯冠軍，李章軒教練也被評為當年A聯賽最佳教練。
李章軒率隊重慶參加2000年足總杯
李章軒在重慶的成功有賴于對球隊的嚴格管理，李某上任後指導俱樂部上司完善球隊的獎懲制度，他與隊員們吃得起，一起生活，以身作則，提高球隊的凝聚力;，羅迪、邱衛國、徐鑫等年輕人都會得到很多他指揮下的機會上場，漸漸在隊伍中挑釁大梁。
2001賽季，重慶隊的表現呈現嚴重下滑，僅以7勝9負的成績，在聯賽排名第11位的賽季結束前，李章軒的指導被蒙上了陰影。
2002賽季，李章軒執教轉會至青島燕中隊，當時李彥彥帶領青島隊在聯賽的指導下取得了9勝9平10負的成績，在聯賽中排名第八。在那個賽季的足總杯上，李章軒麾下的青島隊一路殺入決賽。在最後兩輪比賽中，青島隊在主場1-3失利的情況下，在主場2-0戰勝遼甯隊，憑借客場進球更多的優勢赢得了足總杯，這是青島職業足球曆史上第一次獲得全國冠軍。李章軒率領兩支積分榜首位不上的球隊奪得足總杯冠軍，也讓鐵帥在主場的名聲登上了巅峰。
青島隊奪得足總杯冠軍後，李章軒喜極而泣
2003賽季，青島隊表現不佳，以10勝5平13負結束賽季，雖然在球隊主席、總經理多次留任後，但受挫的李章軒指導下仍選擇離開。
2006年底，離開中國四年的李章軒回到中國，擔任北京國安的主教練。2007賽季，李章軒麾下的北京國安隊15勝9平4負，僅落後長春雅泰1分，位列聯賽亞軍。賽季結束後，國安俱樂部與李章軒在一份為期兩年的續約合同指導下。2008賽季"鐵帥"隊下屬的國安隊取得16勝10平4負，排名聯賽第三。雖然不在聯賽中，但與過去幾年在國安隊聯賽中相比，李在國安隊的指導下取得了明顯的進步。
帶領球隊在訓練場上執教的李章軒
2009賽季，在國安隊主場輸給長春亞泰之後，球隊内部諸多沖突開始爆發，李章軒被俱樂部解雇，随後接任球隊老教練洪元碩指導，最終帶領球隊奪得本賽季聯賽冠軍。
2010年，李章軒從彭維國手中接手廣州教練組，賽季提前三輪，奪得2010賽季A聯賽冠軍 曾經創造聯賽第22輪不敗神話的聯賽冠軍，領先第二名郭安15分，後者在2012賽季被"銀狐"裡皮取代，當時聯賽暫時位居榜首，亞洲人歐冠小組賽上演。
2014年夏天，排名墊底的成都天成隊邀請李章軒指導加盟，幫助球隊保護水準，李章軒在恒大執教時拉着他的球隊，但自從執教成都天成隊以來，李章軒指導和他的球員都沒有得到一分錢的工資和獎金， 球隊最終在賽季結束時降級。賽季結束後，李克強離開了成都。
2016年5月，長春亞泰隊開局慘淡，聯賽前七輪以2平5負的成績登上聯賽積分榜，在斯托揚諾維奇交出帥氣的封印後，亞洲隊迫切需要一位經驗豐富、熟悉的超級教練來幫助球隊走出困境。經過多次談判，在中國打仗多年的李章軒成為最終人選。當賽季處于保護形勢非常嚴峻的時候，在聯賽最後四輪，李章軒在亞泰隊的帶領下取得了四連勝，最終驚心動魄地完成了保護級别。在2017賽季，阿泰俱樂部投入了更多，希望在本賽季擁有職業生涯。出乎意料的是，亞泰開局卻連敗，以一平四負的成績坐上了副裁判的位置。難以忍受的亞泰高層宣布，李章軒指導"回二線"。執教球隊後，陳金剛連赢兩場比賽，一舉逃脫了降級區。随即，雅泰俱樂部官方正式宣布"親鄭"陳金剛指導，李章軒指導無助班。
長春亞泰團隊經理李章軒指導
李章軒是一位有魅力的教練，他自信、不失，敬業的精神值得所有足球教練學習。