主要成員
陸軍中将石井四郎一世
日本細菌戰犯石井四郎
北野醫生 政治 子山 澤班 玉良
日本細菌戰犯 第二任陸軍總司令長野是第二任
此分支
第一部分
淋巴瘟疫，霍亂，炭疽病，傷寒，結核病在活體測試儀中進行了研究。為此目的建造了一座可容納約300人的監獄。朱迪思部長軍事醫療少将。
下：
731名士兵的活體解剖
坂原類（病毒）：研究過濾病毒和局部風土病。班長四郎軍醫太三
田中課（昆蟲）：研究昆蟲。班長田中英雄軍醫邵三
吉村類（凍傷）：研究治療凍傷的有效方法和航空醫學。班長金村壽人軍技術員
高橋班（瘟疫）：研究瘟疫。班長高橋正彥是軍醫
江島班（智濟）：學習明仁和血清學。班長江島金平）陸軍技術員。
泰塔級（炭疽病）：研究炭疽病，班長泰達程軍醫大藏
（霍亂）：研究霍亂。螢幕組成了軍隊技術人員
岡本（病理學）：研究病理學，活體和死亡解剖學。監視者岡本，培養了軍隊技術人員
石川（病理學）：研究病理學并制作人體組織标本。班長 石川大刀 熊丸 陸軍技術員
内海級（血清）：研究血清，開發疫苗，并對感染後的症狀實施細菌學戰時治療
田天闆（傷寒）：研究傷寒。班長水野忠孝和軍醫中總
比木班（TB）：研究結核菌。班長米基秀雄陸軍技術員
草藥類（藥理學）：研究藥理學和毒藥的化學結構。監測草味正福藥水少
野口類（斑疹傷寒）：斑疹傷寒的研究
Fat Fujiban（炭疽）：研究炭疽病，班級組長Fat Fujishin III
類（炭疽）：研究炭疽。顯示器總是很重
在天壇（X射線）：研究其他輻射，如X射線
專班：負責特種秘密監獄的管理和實驗動物的訓練，負責人石井剛南和石井三人
第二部分
研究所學生物武器在戰場上的使用，特别是在傳播細菌和寄生蟲的裝置領域。忠忠忠大造大臣。在諸甲窯安達設有師、航空級和專用實驗室
巴木澤班（植物細菌）：研究植物細菌。螢幕Octopus是一名陸軍技術員
織田級（殺菌）：班長織田Ozo
第三部分
生産含有生物戰劑的炮彈，駐紮在哈爾濱。江口中藏部長下設兩家工廠，主要生産陶瓷外殼制造廠，用于生産"石井式"陶瓷細菌炸彈。還有一個運輸類
第四部分
生産各種生物戰劑，部長川島清少将。每個确診細菌的産生有4個教訓。
第 1 課
山澤闆：細菌制造班組長 佐藤澤西 夏福 軍醫 邵佐
野口：鼠疫細菌和炭疽細菌的産生。班長野口
第2課：研究幹燥細菌和疫苗。負責人，三宮由紀夫
第3課：研究幹燥細菌和疫苗。
第4課（疫苗）
植物村類：生産氣性壞疽和炭疽菌。螢幕種植了趙村
天壇：生産斑疹傷寒和疫苗。螢幕上有田剛軍醫少佐
朝比奈級：螢幕朝向比奈純一郎陸軍技術員
第五部分
教育部由部長小田太郎（Taro Oda）教育訓練，後者後來被中國陸軍醫生中總（Nakaso）取代。負責教育訓練從事細菌武器、細菌戰的人。
第六部分
裝置部大臣大谷少将。負責裝置及裝置的供應。
第七部分
醫務部部長永山大藏。負責日本細菌感染的預防和醫療。
第八部分：總務部，中關部長，後由泰田成軍醫大藏。負責全軍的财務管理、生産計劃和人員配置。
石井的細菌部隊（659部隊）除了平房總部（731部隊）外，還有四個分遣隊：
162部隊
（林口分院）：位于林高縣，分隊隊長西俊英軍醫忠佐，再由湯原秀夫軍醫少佐接任。它有226名日本研究人員。
643部隊
（小馬河或海林分店）：位于海林鎮，分店長尾長尾的男軍醫邵佐。它有200名日本研究人員。
673部隊
（孫武分公司）：位于黑河市孫武縣，分公司負責人西俊英醫中藏。日本有136名研究人員。
543部隊
（海拉爾分公司）：位于海拉爾市，分行隊長加藤恒是一名軍醫。它有226名日本研究人員。
319部隊
（大連市細菌研究所）：位于大連市，前身為南滿洲鐵路有限公司衛生研究所，1939年被配置設定到731部隊