4月20日，2024年第三屆中國青少年足球聯賽女子初、高中年齡段U16組第一階段比賽結束，經過85場激烈角逐，産生了晉級到第二階段的24支球隊。
按照規程，第二屆中青賽U14組前12名的球隊全部獲得晉級到第二階段比賽的資格，本階段在成都溫江賽區的成績将作為第二階段抽簽時分檔的依據。上海U16女足以五戰全勝、進33球一球不失的成績名列B組第一。而在A組，江蘇U16女足和山東U16女足的成績均為4勝1負積12分，江蘇隊因在與山東隊的比賽中1:0獲勝而位列小組頭名。
在山東青島賽區，保定金瑞隊以5戰全勝的成績位列C組第一，大連足校隊和北京女足隊均為3勝1平積10分，分列D組第一和E組第一。合肥滿天星隊、武漢女足隊、海州實驗中學隊列各自小組第二，與前述三隊一起晉級第二階段。
在廣東珠海賽區，廣東二隊以3勝1平積10分的成績名列F組第一，重慶西大附中隊以2勝2平積8分的成績名列G組第一。長沙南雅中學隊和曲靖宜步隊列各自小組第二。上述4隊攜手晉級第二階段。
山東青島的濟南球類中心隊和青島足協隊成為C組-G組中成績最好的兩個第三名，獲得了最後兩個晉級名額。
這24支球隊将在5月23日至6月3日開始第二階段的比賽。24支球隊抽簽分為4個小組，每組6隊進行單循環比賽，各組前4名晉級第三階段。抽簽時第二屆中青賽U14組前12名球隊将根據第一階段成績排名，抽簽落位至各組1-3号位；其他12支球隊按照第一階段比賽成績排名，抽簽落位至各組4-6号位。
第三階段的比賽計劃于8月1日至14日進行，16支球隊通過小組單循環比賽和交叉排位賽決出全部參賽球隊名次。