省級軍區作為全國各個省級行政區的軍事工作機關，因省級區劃的類别不同，省級軍區的名稱也就不盡相同。
在各個省，解放軍設立省軍區，比如貴州省有解放軍貴州省軍區；在各個直轄市，解放軍設立警備區，比如天津市有解放軍天津警備區，因北京有首都的功能，設定的全國唯一的衛戍區——解放軍北京衛戍區；在各個自治區，解放軍設立軍區，比如西藏自治區有解放軍西藏軍區。
上述省級軍區中，比較特殊的既不是省軍區，也不警備區，而是自治區軍區，分别是解放軍新疆軍區、解放軍西藏軍區、解放軍内蒙古軍區、解放軍廣西軍區、解放軍甯夏軍區。
這5大自治區軍區雖然都是大陸五大自治區的軍事工作機關，卻存在很大的差異，主要分為兩類。
一類是以新疆軍區、西藏軍區為一撥；一類是以内蒙古軍區、廣西軍區、甯夏軍區為一撥。
這樣劃分的依據便是兩類自治區軍區的職責任務、主官級别、隸屬關系完全不同。
從隸屬關系的角度說，疆藏兩地的自治區軍區歸軍種性質的陸軍管轄，蒙甯桂三地的自治區軍區已經被納入了軍委直轄的國防動員部管轄。
在七大軍區時代，全國的省級軍區根據所屬省份被劃入到哪個大軍區的防務範圍，那麼省級軍區就被納入到哪個大軍區管轄，比如浙江省在南京軍區的防務範圍，那麼浙江省軍區就歸屬南京軍區管轄；廣西壯族自治區在廣州軍區的防務範圍，那麼廣西軍區就歸廣州軍區管轄；西藏自治區在成都軍區的防務範圍，那麼西藏軍區就歸成都軍區管轄……
當大軍區被戰區所取代後，省級軍區的隸屬關系發生了根本性變化，基于作戰原則，包括内蒙古軍區、甯夏軍區、廣西軍區在内的全國絕大部分省級軍區都歸入到新成立的國防動員部管理，官兵佩戴國防動員機關臂章，而新疆軍區、西藏軍區，外加一個北京衛戍區則轉入了陸軍系統，官兵佩戴陸軍臂章。
鑒于國防動員機關的主官已經打破了陸軍獨大的傳統，海陸空等其他軍種系統的軍官也能任職省級軍區的主官崗位，比如解放軍廣西軍區桂林警備區司令員張漢川大校就是海軍軍官，平時出席活動都是身着海軍軍服，這是疆藏兩地的省級軍區不可能出現的情形。
從職責任務的角度說，疆藏兩地的自治區軍區需要承擔作戰任務的，蒙甯桂三地的自治區軍區已經被剝奪了作戰權限。
在“16軍改”之前，全國很多省級軍區，包含省軍區、直轄市警備區、自治區軍區，多多少少都擁有作戰性質的部隊，比如邊防營、海防大隊等，到了戰時都需要承擔軍事作戰任務。
然而，随着史上最大規模的軍改啟動後，省級軍區基本上被剝奪了作戰權限，一些沿海省份的省級軍區所下轄的海防部隊，以及一些沿邊省份的省級軍區所下轄的邊防部隊全都轉隸到管轄所屬省份的戰區陸軍。
比如浙江省軍區舟山警備區下轄的數個海防團和船運大隊被改編為東部戰區陸軍海防某旅；黑龍江省軍區下轄的某邊防團和烏蘇裡江巡邏艇大隊改編轉隸為北部戰區陸軍邊防某旅；廣西軍區某海防團轉隸為南部戰區陸軍海防某旅；最知名的就是内蒙古軍區某邊防團一連，已經被改編轉隸為北部戰區陸軍某邊防旅三角山邊防連……
内蒙古軍區的邊防部隊和廣西軍區的海防部隊一經轉隸，意味着它們就僅僅承擔國防動員、征兵安置等非戰性軍事工作，徹底與作戰無緣了。甯夏軍區因甯夏回族自治區既不沿邊，也不沿海，自然就不下轄邊海防部隊，和内蒙古軍區、廣西軍區一樣，作為國防動員機關存在。
而新疆軍區和西藏軍區就不一樣了。
疆藏兩地省級軍區的邊防部隊就沒有轉隸，因為它們本身就擁有其他省級軍區所沒有的野戰部隊，一直以軍事作戰機關的性質存在，承擔守邊、護邊、衛邊的重擔。再加上疆藏的省級軍區轉隸到陸軍後，和陸軍集團軍是一個性質，屬于地面作戰的主力部隊之一。
從主官級别的角度說，疆藏兩地的自治區軍區軍政主官都是副戰區級，比蒙甯桂三地的自治區軍區主官要高一級。
新疆軍區在成立之初時，屬于二級軍區，歸屬彭總上司的西北軍區建制；直到1955年5月，以方位命名的大軍區編制撤銷，改編為省城命名的大軍區，西北軍區此時被改編為蘭州軍區，而新疆軍區在西北軍區撤銷後，升格為與蘭州軍區地位平齊的大軍區。
後來，新疆軍區的編制級别以及名稱發生過多次變化，先是在1979年新疆軍區改稱為烏魯木齊軍區，仍是大軍區建制；而後到1985年6月，烏魯木齊軍區與蘭州軍區合編為新的蘭州軍區，同時又成立新的省級軍區性質的新疆軍區，級别定為兵團級，隸屬蘭州軍區上司；再後就是1992年4月，由于全軍取消了兵團級建制，新疆軍區被改編為正軍級機關；最後是在1998年10月，新疆軍區又從正軍級升格為副大軍區級，成為全國第一個升格為副大軍區級的省級軍區，一直延續至今。
和新疆軍區一樣，西藏軍區在成立之初也是二級軍區，歸屬賀龍上司的西南軍區建制；直到1955年大軍區改革，西藏軍區脫離被撤番的西南軍區建制，也沒有歸屬成都軍區，而是升格為大軍區；到了1968年西藏軍區直接從大軍區級降格為正軍級，隸屬成都軍區建制；随着16軍改，西藏軍區得以升格為副戰區級機關。
至此，西藏軍區和新疆軍區的司令員和政委，皆屬于副戰區軍的陸軍中将。
内蒙古軍區在曆史上也曾作為大軍區建制存在過，到了1967年被降格為正軍級的省級軍區，歸屬北京軍區建制，成為全國第一個遭到降格的自治區軍區，一直持續至今；至于說廣西軍區和甯夏軍區，未曾升格為大軍區過，成立以來始終是正軍級的省級軍區。
是以，蒙甯桂三地的自治區軍區的軍政主官，皆屬于正軍級的少将，可以是陸軍少将，也可以是海軍少将，或者空軍少将，唯獨疆藏兩地的軍政主官必須是陸軍中将。