1937年7月，盧溝大橋事件爆發，全面抗日戰争爆發。
随後，根據雙方的協定，紅軍和南部各省的遊擊隊被編入新四軍。
1937年10月，新四軍部成立，軍部設在武漢，但編制不夠全面。直到1938年1月，新四軍才駐紮在南昌，随後成立了軍部各部門。
主要部門負責人有：參謀長賴傳柱、司長兼軍法部主任李毅羅，軍政司副處長黃娮洲，軍旅處處長葉福平，軍事醫務處處長沈啟珍，軍站主任張元壽， 情報處處長、秘書長黃成、組織部部長李子芳、宣傳教育部長朱鏡一、民運工作部長鄧子輝、敵方工作部長林世富、兵役處長。
1、賴傳竹，土地革命時期曾任紅五軍第十三軍政治部秘書長、紅三十七師政委等職務。長征期間，他擔任紅軍第1紅1師政治委員會委員。新四軍前，曾任中國共産黨陝西甘甯省軍事部部長。1955年被授予将軍軍銜。
2、李毅流氓，參加過南昌起義，在中央特支部工作。他參加了長征，并擔任保安局局長。新四軍前，任中國共産黨陝西省宣傳部長。中華人民共和國成立後，曆任駐緬甸大使、外事辦公室副主任等職務。
3、黃相繼周，曾參加過南昌起義、中央紅軍長征，跟随剩餘部隊堅持遊擊鬥争，新組建的第四軍，擔任副參謀長。中華人民共和國成立後，曆任上海市民政局局長、湖北省漁業廳廳長等職務。
4、葉福平，葉挺兄弟，曾參加過南昌起義，失敗的起義轉入地下，從事統一戰線工作。在他擔任新四軍服役團長的兩年中，他于1939年在為軍隊籌集資金的運輸途中死于車禍。
5、沈啟珍，革命期間，在廣州中山大學醫學院，積極參加革命活動。大革命失敗後，他赴日本留學，畢業于日本東京帝國醫科大學，獲醫學博士學位。回家開診所，從事地下活動。新四軍成立後，他成為醫療服務主任。長期從事醫療工作，是中國民軍衛生事業的創始者之一。中華人民共和國成立後，曆任大連醫學院院長、中央衛生研究院院長、中國醫學科學院首任院長，1955年獲委任為中國科學院院士。
6、張元壽，早參加革命，長征負責後勤。新四軍成立了原中央軍委供應司司長。1947年，他在擔任華東野戰軍副參謀長時被國民黨飛機炸死。
7、封印人源，桂家出身。黃埔畢業于軍校，1933年秘密入黨，長期從事地下情報工作，為我黨和我軍提供大量有效情報，曾任第8路軍第115師情報部部長、中央情報部副部長。他于1943年因身份被暗殺。
8、黃成，清華大學入學初期，組織清華大學參加129運動，曾任北平協會會長。1937年盧溝大橋事件後，他在地下反對日本。新四軍成立後，1938年為新四軍工作，1941年閩南事件被捕入獄，1942年被國民黨殺害，逝世。
9、李子芳，早年參加革命，農改時期曾任紅四軍組織部幹事、紅軍第一軍組織部幹事，長征時任紅軍第一軍組織部副部長。緻新四軍 原紅軍政治部組織部部長。他在1941年閩南事件中被捕入獄，1942年被殺。
10、朱鏡一世，早年參加革命，參加中國左翼作家工會的籌備工作。曾任江蘇省委宣傳部部長、上海市中央宣傳部部長。他于1941年在閩南事件中去世。
11、鄧子輝，土地革命時期擔任龍岩縣委宣傳部長，成立西蘇區。他後來擔任紅12軍事和政治委員會，中央财政部長和土地部長。在中央紅軍的主要長征之後，他留在蘇聯地區堅持遊擊隊。新四軍成立後，任新四軍政治部副部長、民主運動部長。中華人民共和國成立後，曆任中南軍委副主席、農村部部長、國務院副總理、政協副主席等職務。
12、林志福早年入盟，曾任國民黨廣東省委書記，後參加反對蔣介石統治的福建事件。新四軍成立後，任政部敵工業部部長，不久加入共産黨。他在1941年閩南事件中被捕，在入獄五年後被保釋。出獄後，他加入了全國民主聯盟，繼續反對蔣介石。中華人民共和國成立後，曆任福建省農業廳廳長、省政協副主席等職務。
13日，朱克靜，北京大學畢業，1922年入黨，曾就讀于蘇聯莫斯科東方大學。他作為軍事代表參加了北伐。1927年，他組織了南昌起義。起義失敗了，四處遊蕩。新四軍成立後，他擔任陸軍政治部顧問和直屬戰地勤務團團長。1947年，起義最初宣布時，于鵬率部叛逃，朱克靜等人當時政委被拘留，随後被關押在南京監獄，國民黨對他們進行脅迫和引誘，他無動于衷，1947年被秘密殺害，英勇犧牲。