由于安卓系統是所謂的開源作業系統，是以在安全方面不像封閉的蘋果系統那樣穩定。是以安全性能一直存在很大問題。雖然谷歌一直在修補安卓系統的漏洞，但是在谷歌商店中不斷出現的惡意應用程式讓安卓系統的名聲受到一定的影響。同時一些容易受到黑客攻擊的第三方安裝安卓系統的裝置，也讓安卓裝置的形象受損。
近期，一些從事網絡安全的研究人員在新加坡舉行的安全會議中發表報告，指出大約有890萬部手機感染了惡意軟體，這些受感染的手機涵蓋50多個品牌。其中在谷歌的應用商店中就包含至少15個含有惡意軟體的應用程式。
研究人員指出，這些受感染的裝置會定期與遠端控制的伺服器進行通信，檢查是否有新的惡意程式需要安裝。有些黑客會通過這些惡意程式收集使用者的個人資訊，然後将這些資料出售給廣告商。研究人員還指出，有些黑客會偷偷地安裝攻擊性廣告平台，這些平台會盡快地耗盡移動裝置的電池能量，進而降低使用者的體驗。并且有些廣告隻向特定地區的使用者顯示。
受到惡意程式感染裝置最多的5個國家是美國、墨西哥、印度尼西亞、泰國和俄羅斯。
安卓裝置中惡意軟體增多可能跟幾個原因有關。
1.一些裝置制造商為了賺取更多的錢，會在裝置中預裝一些惡意軟體。這些軟體通常是不可解除安裝的，并且會收集使用者的個人資訊并将其出售給廣告商。
2.一些裝置制造商可能會在更新裝置軟體時，将舊的惡意軟體替換為新的惡意軟體。
3.許多使用者并不了解如何檢查自己的裝置是否感染了惡意軟體，也不知道如何安全地使用他們的裝置。這使得惡意軟體可以輕易地感染和擴散。
4.美國對于裝置制造商和軟體開發商的監管還不夠嚴格。這使得他們可以輕易地逃避責任，并且繼續在裝置中預裝惡意軟體。
雖然谷歌一直在努力消除惡意軟體對于安卓系統的影響，但是如果缺乏美國監管機構的支援，這個問題，仍然非常難以解決。