Gretna2.0 使用過程中遇到的問題

在做Normalize的時候，報錯“Cannot find T1 image (e.g. *.dcm in T1 Directory), Please Check again!”，但是Pipeline的時候不會報錯。

背景：之前使用Gretna做批處理，進行到一半的時候報錯，說“Something went bad... the pipeline has FAILED”，當時查了一下，發現是第84個被試出了問題，于是以為是第84個被試的資料有問題，就把第84個被試從DICOM和T1資料的檔案夾中移除了，但是并沒有删除GretnaFunNIfTI檔案夾下的subj_0084。同時開始分步運作Gretna。

結果問題就出在“沒有删除GretnaFunNIfTI檔案夾下的subj_0084”，在Gretna的分步計算過程中，輸入變成了GretnaFunNIfTI下的檔案，這樣一來，gretna就會在T1檔案夾下尋找subj_0084，找不到就報錯了。

【備注】調試GUI檔案夾下的gretna_GUI_PreprocessInterface.m檔案

為了避免這類問題，我把Gretna的源代碼進行了修改，使其提示更加人性化，修改的代碼如下：

% modify by supakito
FlagEmptyies = cellfun(@isempty, InputT1FileList);
if any(FlagEmptyies)
	NoT1Subjs = strjoin(SList(find(FlagEmptyies)),',');
	errordlg(['Cannot find T1 image (e.g. *.dcm in T1 Directory), Please Check ',NoT1Subjs]);
	return;
end
% end of modify by supakito
           

用于替換Gretna的gretna_GUI_PreprocessInterface.m中735行的：

if any(cellfun(@isempty, InputT1FileList))
	errordlg('Cannot find T1 image (e.g. *.dcm in T1 Directory), Please Check again!');
	return;
end