能夠從根本上解決制藥生産廢水排放的問題，對環境保護是一件利國利民的大事。各個地區制藥企業多如牛毛，研發制造生産如火如荼。解決生産廢水問題就要從根源上入手，比如廢水的類型、成分、特點等。必須設計出來一系列的廢水處理工藝流程，從預處理-中間過程到生化降解淨化，最終符合要求進行排放。制藥廢水主要特點是有機物多，成分複雜，氨氮高，色度重，毒性大等。這些特點是必須要解決的剛性問題，而解決的方式卻是靈活多樣的。優先選擇節能環保，效率高，效果好，維護友善的工藝方案。
在廢水處理上需要憑借精良的裝置，更需要精湛的設計工藝。要把廢水處理的每個細節問題當做一件正在進行的事情來完成，有始有終才能達到成熟工藝。對于廢水處理廠家來說，每一項成功的工程後面，意味着有成百上千的同類工程。每一項失敗的事情，意味着将來會遇到成百上千的阻礙。廢水處理的目的是為了符合要求，在制藥生産過程中起着至關重要的作用。制藥生産廢水的水量是不穩定的，需要考慮到廢水水量和水質的波動問題。水量的變化好處理，水質發生大幅波動，對工藝來說是一件難以解決的問題。需要在預處理階段進行實時監測，根據變化調整參數和方法，確定處理過程能夠營運良好。
借鑒之前成功的廢水處理經驗和工藝路線是不錯的，但是也要能夠變通。如果廢水的生産環節差異很大，可以考慮分類進行收集處理。在預處理階段，可以節約大量的能耗和投入。預處理主要采用實體和化學方法，具體表現為吸附、沉澱、過濾、離心、氣浮等工藝。初級階段是為了盡最大可能的攔截或過濾掉廢水中的大顆粒物質或高濃度膠體纖維等，使得廢水能夠順利進行微觀化學處理階段，進一步降低廢水的污染能力，提高可生化處理性能。一般都是采用氣浮-沉澱-調節-酸化水解-厭氧有氧-沉澱處理的流程，在具體的實施過程中适當的增加或減少處理步驟，堅持成熟的工藝不會出現大問題，也需要在此基礎上不斷提升和改進，達到增效降本的目的。
堅持嚴謹的工藝路線，廢水處理得到的資料才是精準的。從設計方案到施工現場，從裝置調試到營運過程，除了嚴格按照标準來執行外，還要有足夠的責任心。可能一兩處無意識的更改，就會導緻二次污染或因不達标而出現返工問題。在調試的時候，沖突問題時有發生，從根本上來解決問題才是正确的道路。選擇一個适合的廢水處理廠家是需要認真甄選的，很多時候并不是廢水處理商能力不優秀，而是在針對具體問題沒有經驗或處理不到位。一般的制藥企業都會選擇具有同類型成功的案例，如此才會放心。廢水處理的過程需要很多裝置和原材料，需要具備較強的組織協調能力，并確定各個環節都有條不紊的推進。