給你一個基準，讓你完成樣本間差異分析---FlowJo插件之Downsample
問答模式（聊天框）
我：羅工，我看了上期的秘籍，知道了FlowAI插件可以幫我剔除每個樣本中不好的資料，老闆現在讓我分析樣本間的差異，可我上機時收集的樣本細胞量都不一樣怎麼破？
羅工：FlowJo中的Downsample插件就可以幫你把不同樣本中的細胞降到一個數量級呀！
我：真的嗎？快教教我怎麼做
羅工：第一步：打開FlowJo，然後點選workspace，找到Plugins，選擇安裝好的Downsample插件。（Tips：一定要先點選樣本再點選Downsample，否則插件呈現灰色，無法運作奧）
我：羅工，為什麼我的Plugins點開，卻沒有任何插件呢？
羅工：那是你還沒有安裝插件，複制此連結在網頁打開：https://www.flowjo.com/exchange/#/，把你需要的插件下載下傳到FlowJo安裝包下的Plugins檔案夾下，然後打開FlowJo，點選❤，找到Diagnostics，把插件的路徑複制到對話框中即可。（Tips：切記路徑中不可以出現中文奧）
我：好的羅工，馬上去安排插件的安裝
羅工：第二步：點選Downsample插件，在彈出的對話框中點選Yes，選擇一個儲存的位置，浏覽所有樣本的細胞量，在箭頭所指的對話框中填入細胞量最少（down的水準值）的數字。（Tips：極端資料可去除，否則影響整體分析）
我：我可以了解成大部分樣本收了5w個，有一個樣本收了1w個，就可以把這個資料去掉對吧？
羅工：是的。為了運算快，我down在了1w個細胞量，将綠色剪頭Downsample運算插件拖入All Samples中，可一鍵批處理所有樣本的Downsample運算。（Tips：運作完，檢查所有樣本的細胞量是否down在一個水準，如有異者，重新針對此樣本進行Downsample）
我：好的羅工，做完作業進行檢查是培養了十幾年的好習慣了
羅工：第三步：随機選中某個樣本down完的資料，右擊選擇Select Equivalent Nodes，就可以把所有樣本down完的資料進行選中，然後點選File-Export/Concatenate-Export/Concatenate Populations
我：哇塞，選擇同一邏輯的快捷鍵也太友善了，不用按住ctrl，挨個進行選擇......
羅工：最後一步：在彈出的對話框中選擇Concatenate，點選Advanced Options，可對整合的檔案進行命名（字首Prefix和字尾suffix），點選右下角Concatenate，整合結束選擇檔案儲存位置（建議儲存目前workspace即可），在原始資料下方會生成一個新的fcs資料，就是我們整合完的資料，接下來就可以進行tSNE分析了。