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差異基因分析:fold change(差異倍數), P-value(差異的顯著性)

做基因表達分析時必然會要做差異分析(DE)

DE的方法主要有兩種:

  • Fold change
  • t-test

fold change的意思是樣本質檢表達量的差異倍數,log2 fold change的意思是取log2,這樣可以可以讓差異特别大的和差異比較小的數值縮小之間的差距。

差異基因分析:fold change(差異倍數), P-value(差異的顯著性)

Q-value,是P-value校正值,P值是統計差異的顯著性的。Q值比P值更嚴格的一種統計。

p-value 就是 t-test 來的

差異基因分析:fold change(差異倍數), P-value(差異的顯著性)

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