針對新型冠狀病毒感染的肺炎病例，2020 年 02 月 01 日，浙江省疾病預防控制中心啟用自動化的全基因組檢測分析平台，平台由浙江省疾病預防控制中心、阿裡達摩院醫療 AI 團隊和傑毅生物技術公司共同研發。通過 AI 診斷技術，可将原來數小時的疑似病例基因分析縮短至半小時。
達摩院算法專家顧斐博士在疾控中心基因檢測分析現場
浙江省疾病預防控制中心微生物檢驗所博士孫逸介紹，快速、精确診斷對于目前的疫情控制尤為重要。新型冠狀病毒是基因組序列最長的病毒之一，快速檢測其基因組“全貌”非常困難，而臨床精準診斷又比較依賴這種基因資訊。
專家指出，目前全國大部分醫療機構和疾控部門，普遍采用核酸檢測方法來篩查病例，隻能檢測到病毒基因的局部。一旦病毒發生變異，可能出現漏檢的情況。
新型冠狀病毒結構
據悉，浙江此次啟用的全基因組檢測分析平台可對病毒樣本進行全基因組序列分析比對，能夠有效防止病毒變異産生的漏檢，并将原需數小時的全基因分析流程減少到半小時，大幅提高病例的确診速度和準确率。
具體來說，基于傑毅生物的新型裝置，可以将患者樣本核酸提取、建庫和純化步驟可以在 2 小時内無人值守的完成；在基因分析階段，阿裡巴巴達摩院針對新型冠狀病毒推出了多個算法模型。在序列比對過程中，達摩院對算法增加了分布式設計，有效提升比對效率；在病毒序列拼接階段使用分布式設計的 de Bruijn 圖算法，變異病毒也能精準檢測。
“該平台基于阿裡雲的強大算力與達摩院新算法可以為病毒的解析提供支撐，基于該平台，未來還可以在短時間内将檢測範圍覆寫盡可能多的确診病例，也為後續疫苗與藥物研發打下堅實基礎。”孫逸說。
目前有 6 個确診病例樣本，正在通過該平台進行基因組序列的測定與分析。截至小編發稿前，這些樣本中檢測到的新型冠狀病毒與最早在武漢确診病人身上發現的病毒基因組序列高度同源。
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