曹操殺華佗，民間流行的看法是：曹操多疑，害人害己。這個觀點有個前提：華佗真的會開顱手術。現代醫學中，開顱非常複雜，沒有精密器械、無菌環境，無法完成。華佗僅憑一碗麻藥、一把利斧，根本不可能。
既然不可能，那結論就變了。曹操不是多疑，而是精明。華佗不是無辜，是真的要借機殺曹。事實果真如此嗎？并不是，開顱這段戲，羅貫中純屬虛構。小說中，華佗殺曹操是給關羽報仇的。某些曆史劇中，華佗是為了大漢天下。抛開小說，曆史的真相究竟如何？
華佗和曹操是同鄉，沛國谯縣人，今屬安徽亳州。華佗常年在徐州求學、行醫。正史中，記錄了很多華佗治病救人的案例，其中就有給廣陵郡太守陳登治病的。東漢徐州，相當于今天的江蘇江北和山東南部。州治于彭城，便是徐州市。廣陵郡位于江蘇中部，廣陵縣便是揚州市。
陳登和曹操關系密切，華佗的神奇表現，驚動了曹操，于是将華佗召喚到許縣。許昌這個名字是曹丕稱帝後取得，意思是曹魏的昌盛之地。曹操時代，許昌叫許縣。
據《三國志》記載：“太祖聞而召佗，佗常在左右” ，“後太祖親理，得病笃重，使佗專視”。曹操每次犯頭風，華佗紮幾針，效果立竿見影。後來曹操病情加重，華佗便成了專職醫生。曹操對于華佗的依賴，越來越強。
直到某天，華佗向曹操請假，想回老家。回家的原因，《三國志》說的是：離家久了，思鄉心切。《後漢書》則給出了四點理由：“為人性惡，難得意，且恥以醫見業，又去家思歸”。性格古怪。混得不如意。以行醫為恥。十分想家。
當今世界，醫生、律師是熱門職業。在古代中國，醫生屬于“賤業”。所謂“上醫醫國，中醫醫人，下醫醫病”。華佗本是讀書人，無可奈何當了醫生，社會地位低下，心中很是不情願。
對于華佗請假，曹操雖然不樂意，但還是準許了。曹操明白，想要下屬忠心，就不能太苛刻。華佗回家後，以妻子生病為由，遲遲不歸。曹操多次寫信，并且讓地方官催促，華佗不予理會。于是，曹操很生氣，派人前去查探。果真妻子生病，就賞賜小豆四十斛，并且寬限假期。如果不是，就地鎖拿。
這事很好查，華佗欺騙了曹操，被抓回許縣。曹操要殺華佗，荀彧求情說：華佗醫術非凡，能救人性命，應該寬恕他。曹操回了一句名言：“不憂，天下當無此鼠輩耶？”不要緊，天下能人多的是。就這樣，曹操殺了華佗。
華佗不願侍奉曹操，因為他想服務于普通百姓。曹操是漢賊，這種政治立場，屬于小說虛構。對于曹操殺華佗，後人有着不同的看法。有人認為，曹操蠻橫、不尊重人。也有人覺得，華佗看不清形勢。曹操這種枭雄，給你禮遇，你不樂意還欺騙他，那是自尋死路啊。
還有人說，曹操不是愛才嗎？為什麼不放過華佗？個人覺得，曹操愛才，愛的是“上醫醫國”的能人。荀彧、郭嘉、許褚、關羽，他們犯的錯，曹操能夠包容。對于華佗這種地位低下者，曹操是不能夠容忍欺騙和不忠的。
雖然曹操稱華佗為“鼠輩”，但是在後世，華佗的影響極大。正史為華佗作傳，《三國志》列入《方技傳》，《後漢書》列入《方術列傳》。
在醫學界，華佗被稱為“中醫外科鼻祖”。會腹腔外科手術，發明了麻沸散、五禽戲。如果華佗的醫術沒有失傳，中醫的發展恐怕會遠超想象。至于民間，中國人對于一名醫生的最高評價便是：“華佗在世，妙手回春”。