談到MySql不得不談它的引擎發展曆程，今天就為大家簡單的說下兩者的差別，可能有了解不對的地方，還望大家指出。
MyISAM是MySQL的預設資料庫引擎（5.5版之前），由早期的ISAM（Indexed Sequential Access Method：有索引的順序通路方法）發展而來。雖然性能極佳，但是有一個缺點：不支援事務處理（transaction）。MySQL又引入了InnoDB資料庫引擎，以強化性參考完整與并發違規處理機制，後來就逐漸取代MyISAM。
InnoDB，是MySQL的資料庫引擎之一，為MySQL AB釋出binary的标準之一。InnoDB由Innobase Oy公司所開發，2006年五月時由甲骨文公司并購。與傳統的ISAM與MyISAM相比，InnoDB的最大特色就是支援了ACID相容的事務（Transaction）功能。目前InnoDB采用雙軌制授權，一是GPL授權，另一是專有軟體授權。
MyISAM：每個MyISAM在磁盤上存儲成三個檔案。第一個檔案的名字以表的名字開始，擴充名指出檔案類型。.frm檔案存儲表定義。資料檔案的擴充名為.MYD (MYData)。索引檔案的擴充名是.MYI (MYIndex)。
InnoDB：所有的表都儲存在同一個資料檔案中（也可能是多個檔案，或者是獨立的表空間檔案），InnoDB表的大小隻受限于作業系統檔案的大小，一般為2GB。
MyISAM：可被壓縮，存儲空間較小。支援三種不同的存儲格式：靜态表(預設，但是注意資料末尾不能有空格，會被去掉)、動态表、壓縮表。
InnoDB：需要更多的記憶體和存儲，它會在主記憶體中建立其專用的緩沖池用于高速緩沖資料和索引。
MyISAM：資料是以檔案的形式存儲，是以在跨平台的資料轉移中會很友善。在備份和恢複時可單獨針對某個表進行操作。
InnoDB：免費的方案可以是拷貝資料檔案、備份 binlog，或者用 mysqldump，在資料量達到幾十G的時候就相對痛苦了。
MyISAM：強調的是性能，每次查詢具有原子性,其執行數度比InnoDB類型更快，但是不提供事務支援。
InnoDB：提供事務支援事務，外部鍵等進階資料庫功能。 具有事務(commit)、復原(rollback)和崩潰修複能力(crash recovery capabilities)的事務安全(transaction-safe (ACID compliant))型表。
MyISAM：可以和其他字段一起建立聯合索引。引擎的自動增長列必須是索引，如果是組合索引，自動增長可以不是第一列，他可以根據前面幾列進行排序後遞增。
InnoDB：InnoDB中必須包含隻有該字段的索引。引擎的自動增長列必須是索引，如果是組合索引也必須是組合索引的第一列。
MyISAM：隻支援表級鎖，使用者在操作myisam表時，select，update，delete，insert語句都會給表自動加鎖，如果加鎖以後的表滿足insert并發的情況下，可以在表的尾部插入新的資料。
InnoDB：支援事務和行級鎖，是innodb的最大特色。行鎖大幅度提高了多使用者并發操作的新能。但是InnoDB的行鎖，隻是在WHERE的主鍵是有效的，非主鍵的WHERE都會鎖全表的。
MyISAM：支援 FULLTEXT類型的全文索引
InnoDB：不支援FULLTEXT類型的全文索引，但是innodb可以使用sphinx插件支援全文索引，并且效果更好。
MyISAM：允許沒有任何索引和主鍵的表存在，索引都是儲存行的位址。
InnoDB：如果沒有設定主鍵或者非空唯一索引，就會自動生成一個6位元組的主鍵(使用者不可見)，資料是主索引的一部分，附加索引儲存的是主索引的值。
MyISAM：儲存有表的總行數，如果select count() from table;會直接取出出該值。
InnoDB：沒有儲存表的總行數，如果使用select count() from table；就會周遊整個表，消耗相當大，但是在加了wehre條件後，myisam和innodb處理的方式都一樣。
MyISAM：如果執行大量的SELECT，MyISAM是更好的選擇。
InnoDB：如果你的資料執行大量的INSERT或UPDATE，出于性能方面的考慮，應該使用InnoDB表。DELETE 從性能上InnoDB更優，但DELETE FROM table時，InnoDB不會重建立立表，而是一行一行的删除，在innodb上如果要清空儲存有大量資料的表，最好使用truncate table這個指令。
MyISAM：不支援
InnoDB：支援
綜上所述，基本上可以考慮使用InnoDB來替代MyISAM引擎了，原因是InnoDB自身很多良好的特點，比如事務支援、存儲 過程、視圖、行級鎖定等，在并發很多的情況下，相信InnoDB的表現肯定要比MyISAM強很多。