不同的分析方法需要不同的資料檔案結構，當現有的資料檔案結構與将要進行分析所要求的資料結構不一緻時，我們需要進行資料檔案結構的重組，一般來說資料檔案的結構分析為橫向和縱向兩種結構。
橫向結構
橫向結構的資料将一個變量組中的不同分類分别作為不同的變量，例如将A,B,C作用下的數值分别作為一個變量進行儲存，每一個組是一個觀測量，如圖：
縱向結構
縱向結構的資料将一個變量組中的不同分類分别作為不同的觀測量，例如将A,B,C組作用下的數值作為一個觀測量，如圖：
資料重組方式的選擇
在菜單欄中一次選擇“資料”|“重組”指令，打開如下所示“重組資料向導”對話框。
該對話框提供了三種資料重組方式，分别是“将標明變量組重組為個案”、“将標明個案重組為變量”和“轉置所有資料”，使用者可以根據現有資料的組合方式和将要進行的分析來選擇相應的資料重組方式。
由變量組到觀測量組的重組
變量組到觀測量組的重組将會使資料由橫向格式轉換為縱向格式，首先打開橫向格式儲存的資料檔案。
1）選擇變量組個數
在“重組資料向導”對話框中選擇“標明變量組重組為個案”單選按鈕，單擊“下一步”按鈕，彈出下圖對話框“重組資料向導-第二步（共7步）”對話框。
在此對話框中選擇要重組的變量組個數。這裡隻有一個變量組（A,B,C），選擇“一個”單選按鈕。
2）選擇要重組的變量
單擊“下一步”按鈕，彈出如下的“重組資料向導-第三步”對話框。
（1）“個案組辨別”選項組 該選項組用于設定對觀測記錄的便是變量，在下拉框中有3個選項：
使用個案号，選擇此項系統會出現“名稱”輸入框和“标簽”清單，使用者可以設定重組後序号變量的變量名和變量标簽。
使用標明變量，選擇此項系統會出現一個右箭頭按鈕和“變量”清單，選擇辨別變量，單擊右箭頭按鈕将其選入“變量”清單即可。
無，則表示不适用辨別變量。
（2）“要轉置的變量”選項組 該選項組用于設定需要進行轉置的變量組。“目标變量”下拉框用于指定要進行重組的變量組。指定完成後，選擇相應變量，單擊右箭頭按鈕将其選入“目标變量”清單，組成轉置的變量組。
（3）“固定變量”清單 如果使用者不希望一個變量參加重組，隻需要選擇該變量，單擊右箭頭按鈕将其選入“固定變量”清單即可。
本例中将A,B,C變量選入“要轉置的變量”清單，在“目标變量”後輸入框輸入“D”。
3）選擇索引變量的個數
單擊“下一步”按鈕，彈出如下“重組資料向導--第四步”對話框
該對話框用于設定重組後生成的索引變量的個數，一個或者是多個，也可以選擇無，辨別把索引資訊儲存在某個要轉置重組的變量中，不生成索引變量。本例選擇建立“一個”索引變量。
4）設定索引變量的參數
繼續單擊“下一步”，彈出如下菜單“重組資料向導--第5步”對話框。
索引值是什麼類型選項組：該選項組用于設定索引值的類型，使用者可以選擇有序數組或變量作為索引值得類型。
編輯索引變量的名稱和标簽欄：在該欄中設定索引變量的變量名和變量标簽。
本例，設定索引變量的名稱為“品類”，索引值為變量名，即A，B，C
5）其他參數的設定
單擊“下一步”，彈出“重組資料向導---第6步”對話框。該對話框中有三個選項組設定。
（1）“處理未標明的變量”選項組 該選項組用于設定對使用者未標明變量的處理方式，如選擇“從資料檔案中去掉變量”，系統會敬愛那個這一部分變量删除；如選擇“作為固定變量儲存和處理”，系統會将這一部分變量作為固定變量處理。
（2）“所有已轉置變量中的缺失值或空白值”選項組 該選項組用于設定對要轉置變量中的缺失值和空白值的處理方式，“在新檔案中建立個案”，辨別系統将為這些變量單獨生成觀測記錄；選擇“廢棄資料”，則這一部分觀測值将被删除。
（3）“個案計數變量”選項組 該選項組用于設定是否生成計數變量，勾選“計算有目前資料中的個案建立的新個案的數量”複選框，表示生成計數變量，同時将激活“名稱”和“标簽”輸入框，使用者可以在其中輸入計數變量的變量名和變量标簽，本例中，該步保持預設設定即可。
6）完成資料重組
單擊“下一步”，彈出“重組資料向導---完成”對話框。
這裡可選擇是否立即進行資料重組，如選擇“将本向導生成的已經黏貼到語句視窗”單選按鈕，系統會将相應的指令語句粘貼值語句視窗。
設定完成後，單擊“完成”按鈕即可進行資料重組操作。重組後的資料檔案如下，橫向格式資料檔案轉換成了縱向格式的資料檔案。