postgresql检查点是将shared buffer中的脏页打标记,并集中将其刷到磁盘的动作(fsync)。(期间可能有刷盘的调度,降低当脏页很多时带来的io影响)
在检查点之外,平时bgwriter进程则会使用bufferio的方式(write)将脏页写到os的dirty page。
如果shared buffer非常大,而且数据库应用如果是频繁产生脏页的应用,那么检查点带来的性能影响会非常的明显。
例如shared buffer有100g,活跃数据有100g,同时活跃数据在不停的被update(产生脏页),那么在发生检查点时,fsync的过程中,可能导致性能急剧下降。
接下来重现一下以上问题。
单机开启100个pg实例,每个实例限制一定的内存,cpu,以及io资源,其中日志盘iops限制4000,数据盘iops限制800。
压测方法
每个实例最大数据量1亿,对数据进行随机的upsert操作。
因此全表都是热点。
每个实例连4个连接,同时进行压测。
测试用例参考
<a href="https://github.com/digoal/blog/blob/master/201609/20160927_01.md">20160927_01.md</a>
由于同时开启测试,每个节点几乎在同一时间点进入检查点状态。
产生大量的writeback内存。
通过以下方法可以观察到
解释
在产生了大量的writeback内存计数后,最后检查点调用fsync前,因为脏页没有完全落盘,导致实例的检查点在fsync的阶段需要耗费自己的iops进行刷盘,非常慢。
甚至实例完全不可用。
观察到的现象
数据库整机io很低(只有数据盘的io,并且受到cgroup限制),
tps降到0 (更新块被堵塞) ( shared buffer中没有剩余的块? )
需要等待实例的writeback 全部刷盘后才能恢复。
期间进程状态如下
状态解释
进程stack信息
checkpointer进程
stats收集进程
bgwriter进程
backend process 进程
logger进程
wal writer进程
文件系统已使用data=writeback挂载
postgresql 9.6的检查点改进如下
1. 阶段1(调用write + 检查点调度)
2. 阶段2(调用sync_file_range)
实际上通过设置os调度也能缓解,例如。
3. 阶段3(fsync)
分析
1. 从检查点源码开始
2. 调用buffersync
3. 调用synconebuffer
4. 调用flushbuffer
5. 调用mdwrite
6. 调用filewrite
调用write产生dirty page
7. 调用schedulebuffertagforwriteback
8. 调用issuependingwritebacks
作用见阶段2。
9. 调用issuependingwritebacks
10. 调用smgrwriteback
src/backend/storage/smgr/md.c
11. 调用filewriteback
12. 调用pg_flush_data
src/backend/storage/file/fd.c
(前面已经调用了write,现在告诉os 内核,开始将脏页刷到磁盘)
注意,如果range指定的脏页很多时,sync_file_range的异步模式也可能被堵塞。
调用sync_file_range
异步模式
1. 以上动作做完后,操作系统不一定把dirty page都刷盘了。
因为调用的是异步的sync_file_range。
2. 同时在此过程中,bgwrite, backend process还有可能将shared buffer中新产生的脏页写入os dirty page。
这些脏页也许涉及到接下来检查点需要fsync的文件。
13. 接下来, 检查点开始调用smgrsync
开始fsync文件级别,如果文件又产生了脏页怎么办(见以上不稳定因素分析)。
14. 调用mdsync
15. 调用filesync, 同步整个文件
16. 调用pg_fsync
17. 调用pg_fsync_no_writethrough
18. 调用 fsync 刷盘
1. 调用fsync前,操作系统不一定把dirty page都刷盘了。
因为这两个不安定因素的存在,同时加上环境中有多个pg实例,并且每个pg实例都限制了较小的data盘io,导致fsync时刷盘非常的慢。
redo的io能力远大于data盘的io能力时,checkpoint过程中可能又会产生很多热点脏页。
导致检查点在最后fsync收官时,需要刷dirty page,而同时又被实例的cgroup限制住,看起来就好像实例hang住一样。
是在write阶段进行调度,在sync_file_range和fsync过程中都没有任何调度。

1. 解决不安定因素1 - 避免检查点过程中产生未刷盘的dirty page
在检查点过程中,bgwriter或backend process从shared buffer产生的脏页write out时,会调用write即buffer io。
进入检查点后,bgwriter或backend process从shared buffer产生的脏页write out时,同时记录该page的id到list(1或2)。
2. checkpoint在最后阶段,即调用fsync前,插入一个阶段。
将list(1或2)的page实行sync_file_range,等待其刷盘成功。
使用以下flag
3. 为了防止bgwrite或backend process 与checkpoint 的sync file range冲突。
使用两个list来交替记录检查点开始后的shared buffer evict pages。
4. 新增一个guc变量,配置当checkpoint最后一次sync file range的list page树少于多少时,进入fsync阶段。
允许用户根据iops的规格,配置这个guc变量,从而减少最后fsync时需要等待的page数。
注意这个值也不能设得太小,否则可能造成漫长的很多轮list1和list2的sync file range过程。
需要修改postgresql内核,动作较大。
5. 解决不安定因素2 - 检查点最后的阶段,调用fsync前,确保fd的所有dirty page都已经write out。
目前checkpoint调用的pg_flush_data是异步的sync_file_range,我们需要将其修改为同步的模式。
建议只修改checkoint的调用,不要动到原有的逻辑。
6. 从os内核层面解决io hang的问题。
阿里云rds for postgresql已从数据库内核层面完美的解决了这个问题,欢迎使用。
<a href="http://yoshinorimatsunobu.blogspot.com/2014/03/how-syncfilerange-really-works.html">http://yoshinorimatsunobu.blogspot.com/2014/03/how-syncfilerange-really-works.html</a>
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